Medicinska Föreningens högsta beslutande organ är Fullmäktige (FuM). FuM väljs av Medicinska Föreningens medlemmar, i val som förättas årligen. Det löpande arbetet leds av styrelsen, som rapporterar och ansvarar inför FuM. Styrelsen valbereds efter nominering och kandidatur. Under styrelsen finns flera olika utskott, både utbildningsbevakande och sociala. Varje utskott leds av en utskottsordförande, som väljs av FuM.
Ledamöter FUM 20/21
- Linnea Sandström
- Erik Bolkéus
- Ebba Wallström
- Fabian Grip Rösth
- Egil Borg Bromée
- Ella Nygren
- Agnes Kimblad
- Kristoffer Loo
- Tobias Simrén
- Henrik Davidsson
- Charlotte Nilsson
- Antonia Rejmer
- David Finnhult
- Delicia di Lieto
- Martin Björk
- Ludwig Svesson
- Maja Edman
- Sarah Ivarsson
- Kristina Bergsten
- Joar Åberg
- Gustav Ollvik
Suppleanter FUM 20/21
- Alexander Andersson
- Ellen Asplin
- Johanna Rydell
- Anna Holmgren
- Camilla Lindegren
- Gustav Lovén